Στο χώρο του Ιστορικού Μουσείου Κρήτης φιλοξενείται από τις 28 Νοεμβρίου 2012 έως τις 25 Μαΐου 2013 έκθεση ζωγραφικής του Θωμά Παπαδοπεράκη, με έργα που δώρησαν στο μουσείο η οικογένεια του ζωγράφου και παραχώρησαν ιδιώτες συλλέκτες και ζωγράφοι.

Τα επιλεγμένα έργα αποτυπώνουν τις χαρακτηριστικές τεχνικές του Θωμά Παπαδοπεράκη, τα μαυρισμένα ζωγραφικά έργα και σχέδια.

Στη μεγάλη αίθουσα παρουσιάζονται τα πορτρέτα και τα γυμνά της συλλογής. Στην μικρή αίθουσα παρουσιάζονται οι συνθέσεις και τα σχέδια, ενώ σε επιτοίχιες προθήκες αντιπροσωπευτικά «Πολλαπλά» που παραχώρησε η σύζυγος του Ελένη Παπαδοπεράκη. Στην αίθουσα αυτή έχει διαμορφωθεί ένα ιδιαίτερο περιβάλλον οπτικοακουστικής προβολής συνεντεύξεων του καλλιτέχνη και παρουσίασης των εργαλείων της καλλιτεχνικής του έκφρασης, όπως το καβαλέτο, η παλέτα, τα πινέλα, και η καρέκλα του.